AT3G18850.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.839 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : lysophosphatidyl acyltransferase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
lysophosphatidyl acyltransferase 5 (LPAT5); FUNCTIONS IN: acyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipid/glycerol acyltransferase (InterPro:IPR002123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: lysophosphatidyl acyltransferase 4 (TAIR:AT1G75020.2); Has 1763 Blast hits to 1758 proteins in 511 species: Archae - 0; Bacteria - 640; Metazoa - 539; Fungi - 189; Plants - 155; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 234 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:6499529..6500840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43492.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 375 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKKSVPNSD KLSLIRVLRG IICLMVLVST AFMMLIFWGF LSAVVLRLFS IRYSRKCVSF FFGSWLALWP FLFEKINKTK VIFSGDKVPC EDRVLLIANH 101: RTEVDWMYFW DLALRKGQIG NIKYVLKSSL MKLPLFGWAF HLFEFIPVER RWEVDEANLR QIVSSFKDPR DALWLALFPE GTDYTEAKCQ RSKKFAAENG 201: LPILNNVLLP RTKGFVSCLQ ELSCSLDAVY DVTIGYKTRC PSFLDNVYGI EPSEVHIHIR RINLTQIPNQ EKDINAWLMN TFQLKDQLLN DFYSNGHFPN 301: EGTEKEFNTK KYLINCLAVI AFTTICTHLT FFSSMIWFRI YVSLACVYLT SATHFNLRSV PLVETAKNSL KLVNK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)