AT3G18680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Amino acid kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Amino acid kinase family protein; FUNCTIONS IN: uridylate kinase activity, UMP kinase activity; INVOLVED IN: cellular amino acid biosynthetic process, pyrimidine nucleotide biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aspartate/glutamate/uridylate kinase (InterPro:IPR001048), Uridylate kinase, bacteria (InterPro:IPR015963); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aspartate/glutamate/uridylate kinase family protein (TAIR:AT3G10030.1); Has 10647 Blast hits to 10647 proteins in 2814 species: Archae - 356; Bacteria - 8071; Metazoa - 2; Fungi - 40; Plants - 182; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:6427533..6429520 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36265.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 339 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIPLPLTSC SPISTSSSIS RTSFVPLTLR NRTFFSNQNY SRRVLISCSS SLSSDNGSSP DSMNGNGNGN GSSLNGQSSF PRLPSFDGTS KPPLKWRRVL 101: LKVSGEALAG DEEQNIDPKV TMAIAREVAA VTRLGIEVAI VVGGGNIFRG STWAGCSGLD RSSADYIGML ATVMNAIFLQ ATMESIGIPT RVQTAFRMSE 201: VAEPYIRRRA IRHLEKGRVV IFAAGTGNPF FTTDTAAALR CAEINAEVVL KATNVDGVFD DDPKRNPNAR LLDSLTYQEV TSKDLSVMDM TAITLCQENN 301: IPVVVFNLSE PGNIAKAIKG ERVGTLIGGT WNSIVTTTS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)