AT3G18030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.963 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : HAL3-like protein A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
flavin mononucleotide flavoprotein involved in salt and osmotic tolerance HAL3A encodes for phosphopantothenoylcysteine decarboxylase being involved in Coenzyme A biosynthesis. HAL3A is predominant over another gene with the presumably same function (HAL3B). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
HAL3-like protein A (HAL3A); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Flavoprotein (InterPro:IPR003382); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Flavoprotein (TAIR:AT1G48605.1); Has 7047 Blast hits to 7045 proteins in 2495 species: Archae - 186; Bacteria - 4343; Metazoa - 125; Fungi - 269; Plants - 90; Viruses - 5; Other Eukaryotes - 2029 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:6167883..6168629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23356.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 209 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MENGKRDRQD MEVNTTPRKP RVLLAASGSV AAIKFGNLCH CFTEWAEVRA VVTKSSLHFL DKLSLPQEVT LYTDEDEWSS WNKIGDPVLH IELRRWADVL 101: VIAPLSANTL GKIAGGLCDN LLTCIIRAWD YTKPLFVAPA MNTLMWNNPF TERHLLSLDE LGITLIPPIK KRLACGDYGN GAMAEPSLIY STVRLFWESQ 201: AHQQTGGTS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)