AT3G17880.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : tetraticopeptide domain-containing thioredoxin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a thioredoxin-like disulfide reductase. The protein interacts with the yeast Hsp70 protein Ssb2 in vitro. This interaction is sensitive to the redox status of the thioredoxin domain of AtTDX. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
tetraticopeptide domain-containing thioredoxin (TDX); FUNCTIONS IN: protein binding, oxidoreductase activity, acting on sulfur group of donors, disulfide as acceptor; INVOLVED IN: cell redox homeostasis; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Tetratricopeptide-like helical (InterPro:IPR011990), Thioredoxin domain (InterPro:IPR013766), Thioredoxin, conserved site (InterPro:IPR017937), Thioredoxin-like (InterPro:IPR017936), Tetratricopeptide repeat-containing (InterPro:IPR013026), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336), Tetratricopeptide repeat (InterPro:IPR019734); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HSP70-interacting protein 1 (TAIR:AT4G22670.1); Has 25378 Blast hits to 23097 proteins in 2986 species: Archae - 386; Bacteria - 12513; Metazoa - 3855; Fungi - 1480; Plants - 2453; Viruses - 7; Other Eukaryotes - 4684 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:6123534..6126113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42848.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 380 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVDAIQVAEL RRFVEQLKLN PSILHDPSLV FFKEYLRSLG AQVPKIEKTE RDYEDKAETK PSFSPKHDDD DDDIMESDVE LDNSDVVEPD NEPPQPMGDP 101: TAEVTDENRD DAQSEKSKAM EAISDGRFDE AIEHLTKAVM LNPTSAILYA TRASVFLKVK KPNAAIRDAN VALQFNSDSA KGYKSRGMAK AMLGQWEEAA 201: ADLHVASKLD YDEEIGTMLK KVEPNAKRIE EHRRKYQRLR KEKELQRAER ERRKQQEAQE REAQAALNDG EVISIHSTSE LEAKTKAAKK ASRLLILYFT 301: ATWCGPCRYM SPLYSNLATQ HSRVVFLKVD IDKANDVAAS WNISSVPTFC FIRDGKEVDK VVGADKGSLE QKIAQHSSSK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)