AT3G17790.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purple acid phosphatase 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
purple acid phosphatase 17 (PAP17); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 3 (TAIR:AT1G14700.1); Has 1229 Blast hits to 1218 proteins in 312 species: Archae - 4; Bacteria - 345; Metazoa - 336; Fungi - 8; Plants - 191; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 345 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:6089779..6090988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38299.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 338 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNSGRRSLMS ATASLSLLLC IFTTFVVVSN GELQRFIEPA KSDGSVSFIV IGDWGRRGSF NQSLVAYQMG KIGEKIDLDF VVSTGDNFYD NGLFSEHDPN 101: FEQSFSNIYT APSLQKQWYS VLGNHDYRGD AEAQLSSVLR EIDSRWICLR SFVVDAELVE MFFVDTTPFV KEYYTEADGH SYDWRAVPSR NSYVKALLRD 201: LEVSLKSSKA RWKIVVGHHA MRSIGHHGDT KELNEELLPI LKENGVDLYM NGHDHCLQHM SDEDSPIQFL TSGAGSKAWR GDINPVTINP KLLKFYYDGQ 301: GFMSARFTHS DAEIVFYDVF GEILHKWVTS KQLLHSSV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)