AT3G17465.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ribosomal protein L3 plastid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a putative L3 ribosomal protein targeted to the plastid. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ribosomal protein L3 plastid (RPL3P); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L3 (InterPro:IPR000597), Ribosomal protein L3, bacterial/organelle-type (InterPro:IPR019927), Ribosomal protein L3, conserved site (InterPro:IPR019926), Translation elongation/initiation factor/Ribosomal, beta-barrel (InterPro:IPR009000); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein L3 family protein (TAIR:AT2G43030.1); Has 8719 Blast hits to 8719 proteins in 2855 species: Archae - 267; Bacteria - 5444; Metazoa - 136; Fungi - 140; Plants - 91; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2641 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:5978059..5979572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35406.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 324 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAVPRGLLS RINQFLSIRS ITPSSSESLP HCSSFFLIRR FSSDTGLMDG GGSDIIGAQT RIIEAKQGEM SSRSKRTGII AVKCGMTALW DKWGKRIPIS 101: ILWVDDNIVS QVKTVEKEGI FALQIGCGQK KPKHLSKAVV GHFRAQGVPL KRKLREFPVT EDALLPVGTS LGVRHFVPGQ YVDVTGITRG KGFQGCMKRH 201: GFSGMPASHG ASLSHRSGGS TGQRDAPGKV FKGRKMAGRM GADQRTVKNV WVYKIDPARN LMWVRGQVPG AEGNFVFIKD AWCKKPDISK LPFPTYLAPE 301: DEDPSELEPL VADLGEVDPF MLAE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)