AT3G15990.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.894 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulfate transporter 3;4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes sulfate transporter Sultr3;4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulfate transporter 3;4 (SULTR3;4); FUNCTIONS IN: sulfate transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: sulfate transport, transport, transmembrane transport; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: 10 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, C globular stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulphate transporter (InterPro:IPR011547), Sulphate transporter/antisigma-factor antagonist STAS (InterPro:IPR002645), Sulphate anion transporter, conserved site (InterPro:IPR018045), Sulphate anion transporter (InterPro:IPR001902); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulfate transporter 91 (TAIR:AT1G23090.1); Has 9959 Blast hits to 9880 proteins in 1863 species: Archae - 39; Bacteria - 6009; Metazoa - 1155; Fungi - 419; Plants - 563; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1774 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:5427081..5430679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 71180.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 653 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGHGTNRVED MASPNNGTAG ETVVEIHSVC LPPKKTAFQK LKKRVGDVFF PDDPLQRFRN QTWRNRVILG LQSLFPIFTW GSQYDLKLLR SDVISGLTIA 101: SLAIPQGISY AKLANLPPIV GLYSSFVPPL IYAVLGSSRH LAVGPVSIAS LVMGSMLSES VSPTQDSILY LKLAFTSTFF AGVFQASLGL LRLGFMIDFL 201: SKATLIGFTA GAAVIVSLQQ LKGLLGIVHF TGKMQIVPVM SSVFNHRSEW SWETIVMGIG FLSILLTTRH ISMRKPKLFW ISAASPLASV IISTLLVYLI 301: RSKTHAISFI GHLPKGLNPP SLNMLYFSGA HLALAIKTGI ITGILSLTEG IAVGRTFASL KNYQVNGNKE MMAIGFMNMA GSCTSCYVTT GSFSRSAVNY 401: NAGAKTAVSN IVMASAVLVT LLFLMPLFYY TPNVILAAII LTAVIGLIDY QAAYKLWKVD KFDFFTCLCS FFGVLFVSVP LGLAIAVAVS VIKILLHVTR 501: PNTSEFGNIP GTQIYQSLGR YREASRIPGF LILAIESPIY FANSTYLQDR ILRWAREEEN RIKENNGTTL KCIILDMTAV SAIDTSGLEA VFELRRRLEK 601: QSLQLVLVNP VGTVMEKLHK SKIIEALGLS GLYLTVGEAV ADLSSTWKAN GQP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)