AT3G14210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.903 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : epithiospecifier modifier 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
A semidominant QTL which has an epistatic effect on the Epithiospecifier gene. Represses nitrile formation and favors isothiocyanate production during glucosinolate hydrolysis. The functional allele deters the insect herbivory T. ni. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
epithiospecifier modifier 1 (ESM1); FUNCTIONS IN: hydrolase activity, acting on ester bonds, carboxylesterase activity; INVOLVED IN: glucosinolate catabolic process, response to cold, defense response to bacterium, response to insect; LOCATED IN: in 8 components; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lipase, GDSL (InterPro:IPR001087); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: myrosinase-associated protein, putative (TAIR:AT1G54010.1); Has 1512 Blast hits to 1501 proteins in 69 species: Archae - 0; Bacteria - 44; Metazoa - 1; Fungi - 2; Plants - 1464; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:4729886..4731562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44062.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 392 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADNLNLVSV LGVLLVLTIF HNPIIVYAGE GVPNVALFTF GDSYYDAGNK VFLSQRKDLP QTYWPYGKSR DYPNGKFSDG HIVPDFIADF ISIPNGVLPP 101: VLKPGVDISR GVSFAVADAS ILGAPVESMT LNQQVVKFKN MKSNWNDSYI EKSLFMIYIG TEDYLNFTKA NPNADASAQQ AFVTNVINRL KNDIKLLYSL 201: GASKFVVQLL APLGCLPIVR QEYKTGNECY ELLNDLAKQH NGKIGPMLNE FAKISTSPYG FQFTVFDFYN AVLRRIATGR SLNYRFFVTN TSCCGVGTHN 301: AYGCGKGNVH SKLCEYQRSY FFFDGRHNTE KAQEEMAHLL YGADPDVVQP MTVRELIVYP TGETMREYWE PNNLAIRRRP SRDFYLGLAA YY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)