AT3G12520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulfate transporter 4;2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a sulfate transporter that in induced under sulfate limitation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulfate transporter 4;2 (SULTR4;2); FUNCTIONS IN: sulfate transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: sulfate transport, transport, transmembrane transport; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulphate transporter (InterPro:IPR011547), Sulphate transporter/antisigma-factor antagonist STAS (InterPro:IPR002645), Sulphate anion transporter, conserved site (InterPro:IPR018045), Sulphate anion transporter (InterPro:IPR001902); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulfate transporter 4.1 (TAIR:AT5G13550.1); Has 12030 Blast hits to 11931 proteins in 2162 species: Archae - 35; Bacteria - 7744; Metazoa - 1170; Fungi - 435; Plants - 553; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2093 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:3967976..3971891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74666.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 677 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLAVKDLST ASSSSSKAIP VKIIPLQYPD STSSDPHCHS IPFNDFFSRW TAKIKRMTFF DWIDAIFPCF LWIRTYRWHQ YFKLDLMAGI TVGIMLVPQA 101: MSYARLAGLQ PIYGLYSSFV PVFVYAVFGS SRQLAVGPVA LVSLLVSNAL SGIVDPSEEL YTELAILLAL MVGIFESIMG FLRLGWLIRF ISHSVISGFT 201: TASAVVIGLS QLKYFLGYSV SRSSKIMPVI DSIIAGADQF KWPPFLLGCT ILVILLVMKH VGKAKKELRF IRAAGPLTGL ALGTIIAKVF HPPSITLVGD 301: IPQGLPKFSF PKSFDHAKLL LPTSALITGV AILESVGIAK ALAAKNRYEL DSNSELFGLG VANIFGSLFS AYPTTGSFSR SAVNSESEAK TGLSGLVTGI 401: IIGCSLLFLT PMFKFIPQCA LAAIVISAVS GLVDYEGAIF LWRVDKRDFT LWTITSTTTL FFGIEIGVLI GVGFSLAFVI HESANPHIAV LGRLPGTTVY 501: RNMKQYPEAY TYNGIVIVRI DAPIYFANIS YIKDRLREYE VAIDKHTSKG PDMERIYFVI LEMSPVTYID SSAVEALKDL YEEYKTRGIQ LAISNPNKEV 601: LLTLARAGIV ELIGKEWFFV RVHDAVQVCV HYVNRPTDVE ESSKPSLWRR SGLKNSSTYT EVESNIVLEE PLLSREK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)