AT3G11430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.972 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glycerol-3-phosphate acyltransferase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with glycerol-3-phosphate acyltransferase activity, involved in the biosynthesis of suberin polyester. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glycerol-3-phosphate acyltransferase 5 (GPAT5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipid/glycerol acyltransferase (InterPro:IPR002123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glycerol-3-phosphate acyltransferase 7 (TAIR:AT5G06090.1); Has 397 Blast hits to 386 proteins in 31 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 26; Fungi - 0; Plants - 368; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:3595911..3597678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56084.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 502 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVMEQAGTTS YSVVSEFEGT ILKNADSFSY FMLVAFEAAG LIRFAILLFL WPVITLLDVF SYKNAALKLK IFVATVGLRE PEIESVARAV LPKFYMDDVS 101: MDTWRVFSSC KKRVVVTRMP RVMVERFAKE HLRADEVIGT ELIVNRFGFV TGLIRETDVD QSALNRVANL FVGRRPQLGL GKPALTASTN FLSLCEEHIH 201: APIPENYNHG DQQLQLRPLP VIFHDGRLVK RPTPATALII LLWIPFGIIL AVIRIFLGAV LPLWATPYVS QIFGGHIIVK GKPPQPPAAG KSGVLFVCTH 301: RTLMDPVVLS YVLGRSIPAV TYSISRLSEI LSPIPTVRLT RIRDVDAAKI KQQLSKGDLV VCPEGTTCRE PFLLRFSALF AELTDRIVPV AMNYRVGFFH 401: ATTARGWKGL DPIFFFMNPR PVYEITFLNQ LPMEATCSSG KSPHDVANYV QRILAATLGF ECTNFTRKDK YRVLAGNDGT VSYLSLLDQL KKVVSTFEPC 501: LH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)