AT3G10370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FAD-dependent oxidoreductase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
mitochondrial FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase. possibly involved in storage lipid catabolism and glycerol assimilation, and in glycerol-3-phosphate shuttle which transports reducing power from cytosol to mitochondrion. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
SUGAR-DEPENDENT 6 (SDP6); FUNCTIONS IN: glycerol-3-phosphate dehydrogenase activity; INVOLVED IN: glycerophosphate shuttle, glycerol metabolic process, glycerol catabolic process; LOCATED IN: mitochondrion, mitochondrial inner membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FAD dependent oxidoreductase (InterPro:IPR006076), FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase (InterPro:IPR000447); Has 7040 Blast hits to 7029 proteins in 1867 species: Archae - 83; Bacteria - 4925; Metazoa - 247; Fungi - 177; Plants - 55; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1553 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:3216502..3219027 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 68454.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 629 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLASIRRLA AGAAVIAAAS GGAVYLSPSV ASSDKGGGPI LDSLRRRLGD PTASVPSRSA QESALIAATA SDPLDVLVIG GGATGSGVAL DAVTRGLRVG 101: LVEREDFSSG TSSRSTKLIH GGVRYLEKAV FNLDYGQLKL VFHALEERKQ LIENAPHLCH ALPCMTPCFD WFEVIYFWMG LKMYDLVAGP RLLHLSRYYS 201: AKESIELFPT LARKGKDKNL RGTVVYYDGQ MNDSRLNVGL ACTAALAGAA VLNHAEVVSL ITDDATKRII GARIRNNLTG QEFNSYAKVV VNAAGPFCDS 301: IRKMIDEDTK PMICPSSGVH IVLPDYYSPE GMGLIVPKTK DGRVVFMLPW LGRTVAGTTD SNTSITSLPE PHEDEIQFIL DAISDYLNIK VRRTDVLSAW 401: SGIRPLAMDP TAKSTESISR DHVVFEENPG LVTITGGKWT TYRSMAEDAV DAAIKSGQLK PTNECVTQKL QLLGSYGWEP SSFTTLAQQY VRMKKTYGGK 501: VVPGAMDTAA AKHLSHAYGS MADRVATIAQ EEGLGKRLAH GHPFLEAEVA YCARHEYCES AVDFIARRCR IAFLDTDAAA RALQRVVEIL ASEHKWDKSR 601: QKQELQKAKE FLETFKSSKN AQFNDGKHN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)