AT3G09390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.793 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : metallothionein 2A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
metallothionein, binds to and detoxifies excess copper and other metals, limiting oxidative damage | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
metallothionein 2A (MT2A); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plant metallothionein, family 15 (InterPro:IPR000347); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: metallothionein 2B (TAIR:AT5G02380.1); Has 597 Blast hits to 588 proteins in 128 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 53; Fungi - 2; Plants - 530; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 12 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:2889737..2890188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 8163.52 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 81 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MSCCGGNCGC GSGCKCGNGC GGCKMYPDLG FSGETTTTET FVLGVAPAMK NQYEASGESN NAENDACKCG SDCKCDPCTC K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)