AT3G08990.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.925 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Yippee family putative zinc-binding protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Yippee family putative zinc-binding protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Yippee-like protein (InterPro:IPR004910); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Yippee family putative zinc-binding protein (TAIR:AT2G40110.1); Has 986 Blast hits to 986 proteins in 208 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 469; Fungi - 205; Plants - 239; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 73 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:2743590..2744709 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14607.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 128 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGRLFVIDLE GLVYSCKYCQ THFAVTNDII SKSFHCKHGR AYLFDNVVNV TVGEKEHRVM ITGWHTVADI FCVSCGSLVG WKYEIAYDKS QKYKEGKFIL 101: ERFKVLGPYG GGYDMNQNEP MTGSDDEE |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)