AT3G07560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 peroxisome 0.500 ASURE: cytosol,peroxisome What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : peroxin 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes peroxin 13 (PEX13) involved in protein transport into peroxisomes, for example, peroxisomal import of nitric oxide synthase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
peroxin 13 (PEX13); Has 58927 Blast hits to 16541 proteins in 1193 species: Archae - 47; Bacteria - 25769; Metazoa - 16443; Fungi - 3404; Plants - 6224; Viruses - 432; Other Eukaryotes - 6608 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:2411616..2413310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31288.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 304 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASQPAGGSP PKPWEKEGNT SGPNPFRPPS NTSTAGSVEA SGTANPGEVV PPPVNRPNTA ANMNSLSRPV PARPWEQQNY GSTMGGGYGS NLGMTSGYGS 101: GTYGSALGGY GSSYGGGMYG GSSMYRGGYG GGGLYGSSGM YGGGAMGGYG GTMGGYGMGM GTGMGMGMGM GMGGPYGSQD PNDPFNQPPS PPGFWISFLR 201: VMQGAVNFFG RVAMLIDQNT QAFHMFMSAL LQLFDRGGML YGELARFVLR MLGVRTRPRK MQQPPQGPNG LPLPHQPHGN QNYLEGPKTA APGGGGGWDN 301: VWGN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)