AT3G07270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.752 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GTP cyclohydrolase I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GTP cyclohydrolase I; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GTP cyclohydrolase I/Nitrile oxidoreductase (InterPro:IPR020602); Has 13749 Blast hits to 7133 proteins in 2143 species: Archae - 132; Bacteria - 8697; Metazoa - 425; Fungi - 313; Plants - 76; Viruses - 16; Other Eukaryotes - 4090 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:2315451..2317059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51383.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 466 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGALDEGCLN LELDIGMKNG CIELAFEHQP ETLAIQDAVK LLLQGLHEDV NREGIKKTPF RVAKALREGT RGYKQKVKDY VQSALFPEAG LDEGVGQAGG 101: VGGLVVVRDL DHYSYCESCL LPFHVKCHIG YVPSGQRVLG LSKFSRVTDV FAKRLQDPQR LADDICSALQ HWVKPAGVAV VLECSHIHFP SLDLDSLNLS 201: SHRGFVKLLV SSGSGVFEDE SSNLWGEFQS FLMFKGVKTQ ALCRNGSSVK EWCPSVKSSS KLSPEVDPEM VSAVVSILKS LGEDPLRKEL IATPTRFLKW 301: MLNFQRTNLE MKLNSFNPAK VNGEVKEKRL HCELNMPFWS MCEHHLLPFY GVVHIGYFCA EGSNPNPVGS SLMKAIVHFY GFKLQVQERM TRQIAETLSP 401: LVGGDVIVVA EAGHTCMISR GIEKFGSSTA TIAVLGRFSS DNSARAMFLD KIHTTNALKT ESSSPF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)