AT3G06580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mevalonate/galactokinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with galactose kinase activity. The gene was shown to complement the yeast Ägal1 mutant defective in the galactokinase gene GAL1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
GALK; FUNCTIONS IN: ATP binding, galactokinase activity; INVOLVED IN: galactose metabolic process, carbohydrate phosphorylation; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GHMP kinase, ATP-binding, conserved site (InterPro:IPR006203), GHMP kinase (InterPro:IPR006204), Galactokinase (InterPro:IPR000705), Mevalonate/galactokinase (InterPro:IPR006206), Galactokinase galactose-binding domain (InterPro:IPR019539), Galactokinase, conserved site (InterPro:IPR019741), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold (InterPro:IPR020568), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup (InterPro:IPR014721), GHMP kinase, C-terminal (InterPro:IPR013750); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: arabinose kinase (TAIR:AT4G16130.1); Has 4768 Blast hits to 4465 proteins in 1570 species: Archae - 210; Bacteria - 3137; Metazoa - 280; Fungi - 182; Plants - 144; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 815 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:2049141..2051867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54344.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 496 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKPEEVSVP IFTSLEPVYG EGSLLQEATQ RFDVLKANFN DVFGASPQLF ARSPGRVNLI GEHIDYEGYS VLPMAIRQDT IIAIRKCEDQ KQLRIANVND 101: KYTMCTYPAD PDQEIDLKNH KWGHYFICAY KGFHEYAKSK GVNLGSPVGL DVLVDGIVPT GSGLSSSAAF VCSATIAIMA VFGHNFEKKE LAQLTCECER 201: HIGTQSGGMD QAISIMAKTG FAELIDFNPV RATDVKLPDG GSFVIAHSLA ESQKAVTAAK NYNNRVVECR LASIILGVKL GMEPKEAISK VKTLSDVEGL 301: CVSFAGDRGS SDPLLAVKEY LKEEPYTAEE IEKILEEKLP SIVNNDPTSL AVLNAATHFK LHQRAAHVYS EARRVHGFKD TVNSNLSDEE KLKKLGDLMN 401: ESHYSCSVLY ECSCPELEEL VQVCKENGAL GARLTGAGWG GCAVALVKEF DVTQFIPAVK EKYYKKRVEK GVVKKEDMEL YLFASKPSSG AAIFNL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)