AT3G06440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.656 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Galactosyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Galactosyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring hexosyl groups, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: protein amino acid glycosylation; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Galectin, carbohydrate recognition domain (InterPro:IPR001079), Glycosyl transferase, family 31 (InterPro:IPR002659), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985), Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup (InterPro:IPR013320); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galactosyltransferase1 (TAIR:AT1G26810.1); Has 2377 Blast hits to 2343 proteins in 110 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1703; Fungi - 5; Plants - 611; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 58 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:1972913..1975272 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70639.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 619 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKQFMSVVRF KFGFTSVRMR DWSVGVSIMV LTLIFIIRYE QSDHTHTVDD SSIEGESVHE PAKKPHFMTL EDLDYLFSNK SFFGEEEVSN GMLVWSRMRP 101: FLERPDALPE TAQGIEEATL AMKGLVLEIN REKRAYSSGM VSKEIRRICP DFVTAFDKDL SGLSHVLLEL PCGLIEDSSI TLVGIPDEHS SSFQIQLVGS 201: GLSGETRRPI ILRYNVNFSK PSIVQNTWTE KLGWGNEERC QYHGSLKNHL VDELPLCNKQ TGRIISEKSS NDDATMELSL SNANFPFLKG SPFTAALWFG 301: LEGFHMTING RHETSFAYRE KLEPWLVSAV KVSGGLKILS VLATRLPIPD DHASLIIEEK LKAPSLSGTR IELLVGVFST GNNFKRRMAL RRSWMQYEAV 401: RSGKVAVRFL IGLHTNEKVN LEMWRESKAY GDIQFMPFVD YYGLLSLKTV ALCILGTKVI PAKYIMKTDD DAFVRIDELL SSLEERPSSA LLYGLISFDS 501: SPDREQGSKW FIPKEEWPLD SYPPWAHGPG YIISHDIAKF VVKGHRQRDL GLFKLEDVAM GIWIQQFNQT IKRVKYINDK RFHNSDCKSN YILVHYQTPR 601: LILCLWEKLQ KENQSICCE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)