AT3G03900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.906 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : adenosine-5'-phosphosulfate (APS) kinase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Provides activated sulfate for the sulfation of secondary metabolites, including the glucosinolates. Redundant with APK4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
adenosine-5'-phosphosulfate (APS) kinase 3 (APK3); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring phosphorus-containing groups, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: male gamete generation, sulfate assimilation; LOCATED IN: cytosol; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenylylsulphate kinase, C-terminal (InterPro:IPR002891); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: APS kinase (TAIR:AT2G14750.1); Has 5006 Blast hits to 5006 proteins in 1478 species: Archae - 56; Bacteria - 2976; Metazoa - 240; Fungi - 284; Plants - 130; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1318 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:1002975..1004271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23147.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 208 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSTVGNSTNI FWQESPIGKT ERQKLLNQKG CVVWITGLSG SGKSTLACSL SRELNNRGKL SYILDGDNLR HGLNKDLGFK AEDRVENIRR VGEVAKLFAD 101: AGLICIASLI SPYRKDRDAC REMIQNSSFI EVFMNMSLQL CEARDPKGLY KLARAGKIKG FTGIDDPYES PLNCEIELKE KEGECPSPVA MAEEVISYLE 201: DKGFLQNE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)