AT3G03380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.948 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (mitochondrial marker) v1
Arabidopsis cell culture (plastidal marker) v1
Arabidopsis cell culture (mitochondrial marker) v2
Arabidopsis cell culture (plastidal marker) v2
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DegP protease 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative DegP protease. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DegP protease 7 (DegP7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Serine/cysteine peptidase, trypsin-like (InterPro:IPR009003), Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S (InterPro:IPR001940), PDZ/DHR/GLGF (InterPro:IPR001478); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT3G03370.1); Has 8327 Blast hits to 7895 proteins in 2064 species: Archae - 65; Bacteria - 6254; Metazoa - 235; Fungi - 503; Plants - 137; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1133 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:799720..808319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 119884.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1097 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MGDPLERLGS QASMATESVM KEDLCLEIDP PLTESVATAE DWRRALGKVV PAVVVLRTTA CRAFDTESAG ASYATGFIVD KRRGIILTNR HVVKPGPVVA 0101: EAMFVNREEI PIYPVYRDPV HDFGFFCYDP SAVQFLTYQE IPLAPEAASV GLEIRVVGND SGEKVSILAG TLARLDRDAP HYKKDGYNDF NTFYMQAASG 0201: TKGGSSGSPV IDWQGRAVAL NAGSKSSSAS AFFLPLQRVV RALSFLQKSI DSRTDKPKAV HIPRGTLQMT FLHKGFDEIR RLGLRSETEQ VVRHASPTGE 0301: TGMLVVDSVV PSGPADKHLE PGDVLVRVNG TVLTQFLNLE NLLDDGVGQI LELEIERGGQ PLSVSVSVQD LHSITPDHFL EVSGAVIHPL SYQQARNFRF 0401: PCGLAYVADP GYMLFRAGVP RHAIIKKVAN EDISSLGDLV SVLSKLSRGA RVPLEYMSHT DRHRKKSVLV TIDHHEWYAP PQLYTRNDSS GLWDAKPAIE 0501: PASVSPSIGN NGFPISQDIS LCHHDTEPMH EVNVRGVTDI AAIMETSSGD GSQNDFGSEA KKQRVDEDSS DGIAANGSLY GSEFKSDDAM ETDTTVLRDF 0601: EGATALSANA SLAERAIEPA LVMFEVHVPP SCSLDGVHSQ HFFGTGIIIY HSSNMGLAVV DKNTVAISAS DVMLSFAAFP VEIPGEVVFL HPVHNYALIA 0701: YNPSAMDPAS ASVIRAAELL PEPALQRGDS VYLVGLSRNL QATSRKSIVT NPCAALNIGS ADSPRYRATN MEVIELDTDF GSSFSGALTD EQGRIRAIWG 0801: SFSTQVKYSS TSSEDHQFVR GIPVYAISQV LEKIITGGNG PALLINGVKR PMPLVRILEV ELYPTLLSKA RSFGLSDEWI QVLVKKDPVR RQVLRVKGCL 0901: AGSKAENLLE QGDMVLAVNK MPVTCFNDIE AACQTLDKGS YSDENLNLTI LRQGQELELV VGTDKRDGNG TTRVINWCGC VVQDPHPAVR ALGFLPEEGH 1001: GVYVTRWCHG SPAHRYGLYA LQWIVEVNGK KTPDLNAFAD ATKELEHGQF VRIRTVHLNG KPRVLTLKQD LHYWPTWELR FDPETALWRR NILKALQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)