AT3G03250.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-GLUCOSE PYROPHOSPHORYLASE 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Is thought to encode a cytosolic UDP-glucose pyrophosphorylase with strong similarity to potato UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase. Downregulated by flooding. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
UDP-GLUCOSE PYROPHOSPHORYLASE 1 (UGP1); FUNCTIONS IN: UTP:glucose-1-phosphate uridylyltransferase activity, nucleotidyltransferase activity; INVOLVED IN: in 6 processes; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 30 plant structures; EXPRESSED DURING: 17 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase, subgroup (InterPro:IPR016267), UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase (InterPro:IPR002618); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-glucose pyrophosphorylase 2 (TAIR:AT5G17310.2); Has 1425 Blast hits to 1421 proteins in 430 species: Archae - 0; Bacteria - 404; Metazoa - 339; Fungi - 309; Plants - 217; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 156 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:749761..754014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51741.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 469 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAATTENLPQ LKSAVDGLTE MSESEKSGFI SLVSRYLSGE AQHIEWSKIQ TPTDEIVVPY EKMTPVSQDV AETKNLLDKL VVLKLNGGLG TTMGCTGPKS 101: VIEVRDGLTF LDLIVIQIEN LNNKYGCKVP LVLMNSFNTH DDTHKIVEKY TNSNVDIHTF NQSKYPRVVA DEFVPWPSKG KTDKEGWYPP GHGDVFPALM 201: NSGKLDTFLS QGKEYVFVAN SDNLGAIVDL TILKHLIQNK NEYCMEVTPK TLADVKGGTL ISYEGKVQLL EIAQVPDEHV NEFKSIEKFK IFNTNNLWVN 301: LKAIKKLVEA DALKMEIIPN PKEVDGVKVL QLETAAGAAI RFFDNAIGVN VPRSRFLPVK ASSDLLLVQS DLYTLVDGFV TRNKARTNPS NPSIELGPEF 401: KKVATFLSRF KSIPSIVELD SLKVSGDVWF GSSIVLKGKV TVAAKSGVKL EIPDRAVVEN KNINGPEDL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)