AT3G03090.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 0.500 vacuole 0.500 ASURE: plasma membrane,vacuole What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : vacuolar glucose transporter 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a vacuolar membrane-localized glucose transporter that can also transport fructose. Mutations in these gene have effects on seed germination and time to flowering. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
vacuolar glucose transporter 1 (VGT1); FUNCTIONS IN: carbohydrate transmembrane transporter activity, fructose transmembrane transporter activity, glucose transmembrane transporter activity, sugar:hydrogen symporter activity; INVOLVED IN: glucose transport, positive regulation of flower development, fructose transport, seed germination, response to nematode; LOCATED IN: plant-type vacuole membrane, vacuolar membrane, plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Major facilitator superfamily protein (TAIR:AT5G17010.3); Has 40906 Blast hits to 40365 proteins in 2435 species: Archae - 733; Bacteria - 24523; Metazoa - 4373; Fungi - 7155; Plants - 2379; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1743 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr3:-:700749..704579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 53545.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 7.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | 0.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 503 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGFDPENQSI SSVGQVVGDS SSGGITAEKE PLLKENHSPE NYSVLAAIPP FLFPALGALL FGYEIGATSC AIMSLKSPTL SGISWYDLSS VDVGIITSGS 101: LYGALIGSIV AFSVADIIGR RKELILAAFL YLVGAIVTVV APVFSILIIG RVTYGMGIGL TMHAAPMYIA ETAPSQIRGR MISLKEFSTV LGMVGGYGIG 201: SLWITVISGW RYMYATILPF PVIMGTGMCW LPASPRWLLL RALQGQGNGE NLQQAAIRSL CRLRGSVIAD SAAEQVNEIL AELSLVGEDK EATFGELFRG 301: KCLKALTIAG GLVLFQQITG QPSVLYYAPS ILQTAGFSAA ADATRISILL GLLKLVMTGV SVIVIDRVGR RPLLLCGVSG MVISLFLLGS YYMFYKNVPA 401: VAVAALLLYV GCYQLSFGPI GWLMISEIFP LKLRGRGISL AVLVNFGANA LVTFAFSPLK ELLGAGILFC AFGVICVVSL FFIYYIVPET KGLTLEEIEA 501: KCL |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)