AT3G02570.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Mannose-6-phosphate isomerase, type I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with phosphomannose isomerase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MATERNAL EFFECT EMBRYO ARREST 31 (MEE31); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mannose-6-phosphate isomerase (InterPro:IPR016305), Cupin, RmlC-type (InterPro:IPR011051), Mannose-6-phosphate isomerase, type I (InterPro:IPR001250), RmlC-like jelly roll fold (InterPro:IPR014710), Phosphomannose isomerase, type I, conserved site (InterPro:IPR018050); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mannose-6-phosphate isomerase, type I (TAIR:AT1G67070.1); Has 2386 Blast hits to 2370 proteins in 810 species: Archae - 2; Bacteria - 1207; Metazoa - 570; Fungi - 215; Plants - 91; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 301 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:543463..545478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48568.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 432 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEIATVVKAN GGCEADRRRL RRLRCSVKDY DWGKIGSDSL VYRVYAANSD YEIDPTRPYA ELWMGTHESG PSYLEDADGS NGVTLRSWIT ENPKSLGNRV 101: LEKWGCDLPF LFKVLSVARP LSIQAHPDKK LAKKMHKAHP NLYKDDNHKP EMALAYTQFE ALCGFIPLQE LKSVIRAIPE IEELVGSEEA NQVFCITEHD 201: EEKVKSVVRT IFTLLMSADA DTTKKIVSKL KRRLHMESQE RQLTDKERLV LKLEKQYPND IGVISAFFFN YVKLNPGEAL YLGANEPHAY LFGECLEVMA 301: TSDNVVRAGL TSKPLDIQTL CSMLSYKLGY PEILKGTRIR PYITRYLPPF EEFEVDLCDL PSGASTVFPS VPGPSLLLVL QGEGRMSTEA SADGISMGDV 401: LFVPADTEIH LRSSSDLKLY RAGINSRFLF PL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)