AT3G02110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : serine carboxypeptidase-like 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
serine carboxypeptidase-like 25 (scpl25); FUNCTIONS IN: serine-type carboxypeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S10, serine carboxypeptidase (InterPro:IPR001563), Peptidase S10, serine carboxypeptidase, active site (InterPro:IPR018202); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein (TAIR:AT4G30610.1); Has 3637 Blast hits to 3574 proteins in 364 species: Archae - 0; Bacteria - 191; Metazoa - 636; Fungi - 868; Plants - 1530; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 412 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:370902..373637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53403.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 473 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMAKLAIFT TLMAILVMTS QGRIPTEGGE KEAEADRITS LPGQPNVTFE QFSGYVTVDK LSGRSLFYWL TEASDLPLSK PLVIWLNGGP GCSSVAYGAS 101: EEIGPFRISK GGSGLYLNKF AWNSISNLLF LEAPAGVGFS YTNRSSDLFN TGDRRTAKDS LQFLIQWLHR FPRYNHREIY ITGESYAGHY VPQLAKEIMN 201: YNKRSKNPLN LKGIMVGNAV TDNHYDNLGT VSYWWSHAMI SDRTYHQLIS TCDFSRQKES DECETLYSYA MEQEFGNIDQ YNIYAPPCNK SSDGGGSYNG 301: SSGRRSMRLP HLPHSVLRKI SGYDPCTERY AEIYYNRPDV QKALHANTTK IPYKWTACSE VLNRNWNDTD STVLPIYREM IAGGIRVWVF SGDVDSVVPV 401: TATRYSLARL SLSTKLPWYP WYVKKQVGGW TEVYEGLTFV TVRGAGHEVP LFKPRAAFEL FKYFLRGKPL PKA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)