AT3G01770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : bromodomain and extraterminal domain protein 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
bromodomain and extraterminal domain protein 10 (BET10); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Bromodomain (InterPro:IPR001487); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: bromodomain and extraterminal domain protein 9 (TAIR:AT5G14270.2); Has 12383 Blast hits to 9735 proteins in 571 species: Archae - 25; Bacteria - 644; Metazoa - 6126; Fungi - 1754; Plants - 803; Viruses - 19; Other Eukaryotes - 3012 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:275582..278386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 69885.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 620 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTVRNGGFPG DYNRNSFDSP GGCDDSPNAS KDDETFGVPR IVLPLSDLSS SERRKWIHTL RQELEQLRSF QKSVGDLLPI SKIVTSTPAS NVSRPKSFGM 101: SRCSTGPGKR VLPFTATKPE PVTTSTMLRM KQCESLLKRL MSQQHCWLFN TPVDVVKLNI PDYFTIIKHP MDLGTVKSKL TSGTYSSPSE FSADVRLTFR 201: NAMTYNPSDN NVYRFADTLS KFFEVRWKTI EKKSSGTKSE PSNLATLAHK DIAIPEPVAK KRKMNAVKRN SLLEPAKRVM TDEDRVKLGR DLGSLTEFPV 301: QIINFLRDHS SKEERSGDDE IEIDINDLSH DALFQLRDLF DEFLRENQKK DSNGEPCVLE LLHGSGPGNS LTQHCDGSEL EDEDVDIGNY EHPISHISTV 401: RTEKDSVGGL NQMEDASRGK LSLIEGADGH QDGNSAPKEK ELPPEKRYRA ALLKNRFADI ILKAQEITLN QNEKRDPETL QREKEELELQ KKKEKARLQA 501: EAKEAEEARR KAEAQEAKRK LELEREAARQ ALLEMEKSVE INENTRFLKD LELLKTVNTD QLRNLRDVGS ESDGLAVFGF GGSNPLEQLG LFMKHEEDED 601: ESDMLAFPDP GNEVEEGEID |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)