AT3G01640.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glucuronokinase G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
AtGlcAK is a sugar kinase able to phosphorylate D-GlcA to D-GlcA-1-phosphate in the presence of ATP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glucuronokinase G (GLCAK); FUNCTIONS IN: poly(U) RNA binding, glucuronokinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: cell wall biogenesis, inositol metabolic process, pollen tube development; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mevalonate/galactokinase (InterPro:IPR006206), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold (InterPro:IPR020568), GHMP kinase (InterPro:IPR006204), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup (InterPro:IPR014721), GHMP kinase, C-terminal (InterPro:IPR013750); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GHMP kinase family protein (TAIR:AT5G14470.1); Has 420 Blast hits to 420 proteins in 152 species: Archae - 38; Bacteria - 195; Metazoa - 13; Fungi - 2; Plants - 68; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 104 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:239418..241198 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40078.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 362 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDPNSTVSGD GQATAAIEHR SFARIGFLGN PSDVYFGRTI SLTIGNFWAS VKLEPSEHLV IKPHPFHDLV QFTSLDHLLN RLQNEGYYGG VRLLMAICKV 101: FRNYCKENDI QLHQANFSLS YDTNIPRQTG LSGSSAIVSA ALNCLLDFYN VRHLIKVQVR PNIVLSAEKE LGIVAGLQDR VAQVYGGLVH MDFSKEHMDK 201: LGHGIYTPMD ISLLPPLHLI YAENPSDSGK VHSMVRQRWL DGDEFIISSM KEVGSLAEEG RTALLNKDHS KLVELMNLNF DIRRRMFGDE CLGAMNIEMV 301: EVARRVGAAS KFTGSGGAVV VFCPEGPSQV KLLEEECRKA GFTLQPVKIA PSCLNDSDIQ TL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)