AT3G01420.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Peroxidase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an alpha-dioxygenase involved in protection against oxidative stress and cell death. Induced in response to Salicylic acid and oxidative stress. Independent of NPR1 in induction by salicylic acid. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DOX1; FUNCTIONS IN: lipoxygenase activity; INVOLVED IN: in 6 processes; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 9 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Haem peroxidase, animal (InterPro:IPR002007); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha dioxygenase (TAIR:AT1G73680.1); Has 1465 Blast hits to 1381 proteins in 214 species: Archae - 0; Bacteria - 94; Metazoa - 1085; Fungi - 168; Plants - 70; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 47 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:159689..162726 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 73161.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 639 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKVITSLISS ILLKFIHKDF HEIYARMSLL DRFLLLIVHG VDKMVPWHKL PVFLGLTYLE VRRHLHQQYN LLNVGQTPTG IRFDPANYPY RTADGKFNDP 101: FNEGVGSQNS FFGRNCPPVD QKSKLRRPDP MVVATKLLGR KKFIDTGKQF NMIAASWIQF MIHDWIDHLE DTHQIELVAP KEVASKCPLS SFRFLKTKEV 201: PTGFFEIKTG SQNIRTPWWD SSVIYGSNSK TLDRVRTYKD GKLKISEETG LLLHDEDGLA ISGDIRNSWA GVSALQALFI KEHNAVCDAL KDEDDDLEDE 301: DLYRYARLVT SAVVAKIHTI DWTVQLLKTD TLLAGMRANW YGLLGKKFKD SFGHAGSSIL GGVVGMKKPQ NHGVPYSLTE DFTSVYRMHS LLPDQLHILD 401: IDDVPGTNKS LPLIQEISMR DLIGRKGEET MSHIGFTKLM VSMGHQASGA LELMNYPMWL RDIVPHDPNG QARPDHVDLA ALEIYRDRER SVPRYNEFRR 501: SMFMIPITKW EDLTEDEEAI EVLDDVYDGD VEELDLLVGL MAEKKIKGFA ISETAFYIFL IMATRRLEAD RFFTSDFNET IYTKKGLEWV NTTESLKDVI 601: DRHYPDMTDK WMNSESAFSV WDSPPLTKNP IPLYLRIPS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)