AT3G01200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PPDK regulatory protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a PPDK regulatory protein that has protein kinase activity but lacks protein phosphatase activity towards PPDK (pyruvate orthophosphate dikinase). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PPDK regulatory protein 2 (RP2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyruvate Pi dikinase regulator (InterPro:IPR017409), Protein of unknown function DUF299, phosphotransferase, predicted (InterPro:IPR005177); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PPDK regulatory protein (TAIR:AT4G21210.1); Has 4458 Blast hits to 4458 proteins in 1423 species: Archae - 0; Bacteria - 3131; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 63; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1264 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:69826..71348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41388.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 377 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNLHGVSGHH EPNSEPPIPT GSSSPKLKIS PKLNRWSRGR ALRSGVKLDR PIPRSDNSPR RQVTEAQPTD EADKKTTAID VEVTAGKSIY LVSDGTGWTA 101: EHSVNAALGQ FEDFSLNRGS SVNTHLFSWV EDEERLIEII KQAAKEGAMC FYTLANPSMA KSAKQACDQL GVLSVDILGP IIEGIASHLG VSPSGLTRGA 201: PGRVKTLNDA YFKRIEAIEF TIKQDDGTLP ENLSKADIVL VGVSRTGKTP LSTYIAQKGY KVANVPFVMG VEPPRTLFQV EPRKVFGLKI QLVVLQAIRR 301: TRVKTLGVDT EAENNYSGID LVRKELDFAS RIYERNPGWA VIDVTNKAIE ETAAVILRLY HDGRDTSTTV PRISKRY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)