AT2G47210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : myb-like transcription factor family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
myb-like transcription factor family protein; FUNCTIONS IN: DNA binding, sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: N-terminal protein myristoylation, negative regulation of transcription, regulation of transcription, DNA-dependent; LOCATED IN: nucleus; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SANT, DNA-binding (InterPro:IPR001005), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), DNA methyltransferase 1-associated 1 (InterPro:IPR008468); Has 383 Blast hits to 375 proteins in 190 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 140; Fungi - 145; Plants - 43; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 53 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:19379039..19382204 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49826.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 441 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGGTDAKDIL GLPKTPLSLT QEKKSRPQKE SHRKPDGISR EVYALTGGVA PLMPSIDLKR RPPADEKVAW KWLSFTNSAR KDDLQLYHWV RVVNDVPPTG 101: DYSFAKYNKS VDILKYTDEE YENHLTDSVW TKEETDQLFE FCQNFDLRFV VIADRFPVSR TVEELKDRYY SVNRALLRAR AQSPADVANH PLMKEPYDIT 201: RDRERKRALS MVLSQSRHQE KKDAEILAEA KRITEMRLAA RRAEEPDVSA NENAGLDKAD GVVPGRSVSP TSNSQLPATA VAPSTLTMAD YASTLASLRM 301: LHVYLRTYGL EQMVQAASSA VGLRTIKRVE QTLQDLGVNL KPKVPTKTVC DEHLELRKEI LTLLNLQKQL QYKESEGSSH REGSYAAMPD TPKDRVFAPD 401: PFSFGAERPI KKEQKRKGPG RQADTPSPAH KRPRKLKASD L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)