AT2G46820.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : photosystem I P subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes the P subunit of Photosystem I. About 25% of the TMP14 pool appeared to be phosphorylated, and this ratio is not affected by light. Contains seven phosphorylation sites on threonine residue and chloroplast targeting signal. Located in the proximity of PSI-L, -H and -O subunits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
photosystem I P subunit (PSI-P); FUNCTIONS IN: DNA binding; INVOLVED IN: photosynthetic electron transport in photosystem I; LOCATED IN: in 7 components; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G52220.1); Has 450 Blast hits to 450 proteins in 73 species: Archae - 0; Bacteria - 149; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 208; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 93 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:19243729..19244870 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18483.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 174 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLSVSSSS TIIDSRAPPS RLASASASSP SCISLPTLPI QSHTRAAKAT AYCRKIVRNV VTRATTEVGE APATTTEAET TELPEIVKTA QEAWEKVDDK 101: YAIGSLAFAG VVALWGSAGM ISAIDRLPLV PGVLELVGIG YTGWFTYKNL VFKPDREALF EKVKSTYKDI LGSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)