AT2G46740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : D-arabinono-1,4-lactone oxidase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
D-arabinono-1,4-lactone oxidase family protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, D-arabinono-1,4-lactone oxidase activity, FAD binding, catalytic activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: cell wall; EXPRESSED IN: leaf apex, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: D-arabinono-1,4-lactone oxidase (InterPro:IPR007173), FAD-binding, type 2 (InterPro:IPR016166), Plant-specific FAD-dependent oxidoreductase (InterPro:IPR010030), FAD linked oxidase, N-terminal (InterPro:IPR006094); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: D-arabinono-1,4-lactone oxidase family protein (TAIR:AT2G46750.1); Has 2786 Blast hits to 2671 proteins in 804 species: Archae - 14; Bacteria - 1897; Metazoa - 120; Fungi - 214; Plants - 254; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 287 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:19205182..19207455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64893.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 590 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFGYSPSYC SFWRTLLGLY CLFTLVHTVI STPPEDPVKC VSGNTNCIVT NSLGAFPDRS TCRAANVAYP TTEAELVSIV AAATKAGRKM RVTTRYSHSI 101: PKLTCTDGND GLFISTKFLN HTVQADAKAM TLTVESGVTL RQLIAEAAKV GLALPYAPYW WGVTVGGMMG TGAHGSSLWG KGSAVHDYVT EIRMVSPGSV 201: NDGFAKIRVL SETTTPNEFN AAKVSLGVLG VISQVTFELQ PMFKRSLKYV MRNDLDFNDE ALTFGKKHEF ADFVWLPSQG KVVYRMDDRV AVNTLGNGLY 301: DFFPFRSQLS AVLATTRSSE ETQETLRDAH GKCVTATTIS STLFSTSYGL TNNGITFTGY PVIGSQNRMM SSGSCLDGLE DKLTSACAWD SRVKGVFYHQ 401: TTFSIPLTQV KSFINDIKSL LKIDSKSLCG LELYYGILMR YVTSSPAYLG KETEAIDFDI TYYRANDPLT PRLYEDFIEE IEQIALLKYN ALPHWGKNRN 501: LAFDGVIKKY KNAPAFLKVK ESYDPNGLFS SEWTDQILGI KGNPTIVKDG CALEGLCICS DDAHCAPSKG YLCRPGKVYK EARVCTHVPK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)