AT2G45600.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.991 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
alpha/beta-Hydrolases superfamily protein; FUNCTIONS IN: hydrolase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lipase, GDXG, active site (InterPro:IPR002168), Alpha/beta hydrolase fold-3 (InterPro:IPR013094); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein (TAIR:AT2G45610.1); Has 9264 Blast hits to 9243 proteins in 1540 species: Archae - 114; Bacteria - 5273; Metazoa - 690; Fungi - 865; Plants - 1337; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 982 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18789799..18790788 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36426.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 329 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEAPPPSSDP YKFLNITLNS DGSLTRHRDF PKLPPTEQSK DIPLNQTNNT FIRIFKPRNI PPESKLPILV YFHGGGFILY SAASAPFHES CTKMADRLQT 101: IILSVEYRLA PEHRLPAAYE DAVEAILWLR DQARGPINGG DCDTWLKDGV DFSKCYVMGS SSGGNIVYNV ALRVVDTDLS PVKIQGLIMN QAFFGGVEPS 201: DSESRLKDDK ICPLPATHLL WSLCLPDGVD RDHVYSNPIK SSGPQEKDKM GRFPSTLING YGGDPLVDRQ RHVAEMLKGR GVHVETRFDK DGFHACELFD 301: GNKAKALYET VEAFMKSCSS TGPSSNSNM |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)