AT2G45150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.977 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytidinediphosphate diacylglycerol synthase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
cytidinediphosphate diacylglycerol synthase 4 (CDS4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphatidate cytidylyltransferase (InterPro:IPR000374); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytidinediphosphate diacylglycerol synthase 5 (TAIR:AT3G60620.1); Has 7499 Blast hits to 7494 proteins in 2620 species: Archae - 2; Bacteria - 5196; Metazoa - 180; Fungi - 137; Plants - 143; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1841 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18613402..18615347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46776.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 430 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTNTNTLFLR HDDDSEILIF QENSVFPLFV FASWGIWRAM ATFAELVLST SRCTCPCRSF TRKPLIRPPL SGLRLPGDTK PLFRSGLGRI SVSRRFLTAV 101: ARAESDQLGD DDHSKGIDRI HNLQNVEDKQ KKASQLKKRV IFGIGIGLPV GCVVLAGGWV FTVALASSVF IGSREYFELV RSRGIAKGMT PPPRYVSRVC 201: SVICALMPIL TLYFGNIDIL VTSAAFVVAI ALLVQRGSPR FAQLSSTMFG LFYCGYLPSF WVKLRCGLAA PALNTGIGRT WPILLGGQAH WTVGLVATLI 301: SFSGVIATDT FAFLGGKTFG RTPLTSISPK KTWEGTIVGL VGCIAITILL SKYLSWPQSL FSSVAFGFLN FFGSVFGDLT ESMIKRDAGV KDSGSLIPGH 401: GGILDRVDSY IFTGALAYSF IKTSLKLYGV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)