AT2G44480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.623 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : beta glucosidase 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
beta glucosidase 17 (BGLU17); FUNCTIONS IN: cation binding, hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds, catalytic activity; INVOLVED IN: carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: stem, hypocotyl, sepal, male gametophyte, root; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, family 1 (InterPro:IPR001360), Glycoside hydrolase, family 1, active site (InterPro:IPR018120), Glycoside hydrolase, catalytic core (InterPro:IPR017853), Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core (InterPro:IPR013781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: beta glucosidase 15 (TAIR:AT2G44450.1); Has 11437 Blast hits to 11059 proteins in 1476 species: Archae - 140; Bacteria - 7925; Metazoa - 696; Fungi - 198; Plants - 1473; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1005 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18359780..18363001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59123.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 517 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIKSIFIII IISIITSISE LYALDPSFLR LSTSLQRSSF PQDFRFGAAS SAYQSEGAAN VDGREPSIWD TFTKQYPEKI SDGSNGDVAD EFYYRFKEDV 101: AHMKEIGLDS FRFSISWSRI LPRGTVAGGV NQAGINFYNH LINELISNGI RPLVTLFHWD TPQALEDEYG GFLNPQIVKD FVEYVDICFK EFGDRVKEWI 201: TINEPNMFAV LGYNVGNIAP GRCSSYVQNC TVGNSATEPY LVAHYLILSH AATVQLYREK YQSFHGGTIG MTIQTYWMIP KYNTPACREA AKRALDFFFG 301: WFADPITYGD YPKTMRELVG NRLPKFTKKQ SKMVRGSFDF FGLNYYTSRY VEDVMFYANT NLSYTTDSRV NQTTEKNGVP VGEPTSADWL FICPEGFQDV 401: LLYIKSKFQN PVILVTENGM PSENDKSLSV NIALNDEAKI KYHQLHLTAL LEAVSQGADV RGYYIWSLMD DFEWEFGYKY RYGLVYVDFQ DGLKRHLKSS 501: ALWYHHFLSN SSSYQMD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)