AT2G43760.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.913 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : molybdopterin biosynthesis MoaE family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
molybdopterin biosynthesis MoaE family protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: Mo-molybdopterin cofactor biosynthetic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Molybdopterin biosynthesis MoaE (InterPro:IPR003448); Has 4667 Blast hits to 4667 proteins in 1622 species: Archae - 178; Bacteria - 3163; Metazoa - 146; Fungi - 92; Plants - 52; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1036 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18133276..18133872 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22217.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 198 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSAEEKNLIE ILEEGHKVDV VKYIDYVSAP QAGAIATFSG TTRDMFEGKT VLELRYEAYV PMATRCLSSI CTTARSTWDI HKIAVAHRLG PVPVGETSVL 101: IAVSSVHRAD GLDACKFLID ELKASVPIWK KEVYTNGEIW KENSEFMEKR LELAEKRDSI VKKTVVEEHR RRGCCGSKVR VEEDEEHKDI TGDNKSSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)