AT2G43560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (plastidal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein; FUNCTIONS IN: FK506 binding, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity; INVOLVED IN: protein folding; LOCATED IN: thylakoid, thylakoid lumen, chloroplast thylakoid lumen, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type (InterPro:IPR001179); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FK506-binding protein 13 (TAIR:AT5G45680.1); Has 8823 Blast hits to 8572 proteins in 1646 species: Archae - 42; Bacteria - 4685; Metazoa - 1489; Fungi - 464; Plants - 749; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1394 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18073995..18075385 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23565.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 223 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAASSPSLLL PLGSASRNGL TTKNPNSSRY IAARVIASET REQSCKISNL SSRREAMLLV LGVSGGLSMS SLAAYAAGLP PEDKPRLCEA ECEKELENVP 101: MVTTESGLQY KDIKVGRGPS PPVGFQVAAN YVAMVPSGQI FDSSLEKGLP YLFRVGSGQV IKGLDEGILS MKAGGKRRLY IPGPLAFPKG LVSAPGRPRV 201: APNSPVIFDV SLEFIPGLDS EEE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)