AT2G43350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutathione peroxidase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Glutathione peroxidase. Functions as both a redox transducer and a scavenger in abscisic acid and drought stress responses. Interacts with ABI2 and ABI1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutathione peroxidase 3 (GPX3); FUNCTIONS IN: glutathione peroxidase activity; INVOLVED IN: response to hydrogen peroxide, abscisic acid mediated signaling pathway, cellular response to water deprivation; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336), Glutathione peroxidase (InterPro:IPR000889); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutathione peroxidase 1 (TAIR:AT2G25080.1); Has 7324 Blast hits to 7323 proteins in 1740 species: Archae - 2; Bacteria - 3505; Metazoa - 790; Fungi - 210; Plants - 383; Viruses - 8; Other Eukaryotes - 2426 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18009195..18010533 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23259.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 206 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPRSSRWVNQ RATSKIKKFI LFLGVAFVFY LYRYPSSPST VEQSSTSIYN ISVKDIEGKD VSLSKFTGKV LLIVNVASKC GLTHGNYKEM NILYAKYKTQ 101: GFEILAFPCN QFGSQEPGSN MEIKETVCNI FKAEFPIFDK IEVNGKNTCP LYNFLKEQKG GLFGDAIKWN FAKFLVDRQG NVVDRYAPTT SPLEIEKDIV 201: KLLASA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)