AT2G41310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : response regulator 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an A- type response Regulator that is primarily expressed in the root and is involved in cytokinin-mediated signalling. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
response regulator 3 (RR3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: CheY-like (InterPro:IPR011006), Signal transduction response regulator, receiver domain (InterPro:IPR001789); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: response regulator 9 (TAIR:AT3G57040.1); Has 36974 Blast hits to 36596 proteins in 2486 species: Archae - 189; Bacteria - 32197; Metazoa - 9; Fungi - 371; Plants - 1334; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 2870 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:17222280..17223536 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25472.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 225 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVMETESKFH VLAVDDSLFD RKMIERLLQK SSCQVTTVDS GSKALEFLGL RVDDNDPNAL STSPQIHQEV EINLIITDYC MPGMTGYDLL KKVKESAAFR 101: SIPVVIMSSE NVPARISRCL EEGAEEFFLK PVKLADLTKL KPHMMKTKLK KESEKPVAIE EIVVSKPEIE EEEEESSVIE ILPLHQEIES EQLEPMLSSN 201: KRKAMEEVVS TDRSRPKYND ITTSV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)