AT2G40540.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : potassium transporter 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
putative potassium transporter AtKT2p (AtKT2) mRNA, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
potassium transporter 2 (KT2); FUNCTIONS IN: potassium ion transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: potassium ion transport; LOCATED IN: plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Potassium uptake protein, kup (InterPro:IPR018519), K+ potassium transporter (InterPro:IPR003855); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Potassium transporter family protein (TAIR:AT5G14880.1); Has 3466 Blast hits to 3370 proteins in 1021 species: Archae - 13; Bacteria - 2381; Metazoa - 1; Fungi - 99; Plants - 847; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 121 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:16931445..16934516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 88635.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 794 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDLNLGKCCG SRSSKKESWR SVLLLAYQSL GVVYGDLSIS PLYVFKSTFA EDIQHSETNE EIYGVMSFVF WTLTLVPLLK YVFIVLRADD NGEGGTFALY 101: SLICRHVKVS LLPNRQVSDE ALSTYKLEHP PEKNHDSCVK RYLEKHKWLH TALLLLVLLG TCMVIGDGLL TPAISVFSAV SGLELNMSKE HHQYAVIPIT 201: CFILVCLFSL QHFGTHRVGF VFAPIVLTWL LCISGIGLYN IIQWNPHIYK ALSPTYMFMF LRKTRVSGWM SLGGILLCIT GAEAMFADLG HFNYAAIQIA 301: FTFLVYPALI LAYMGQAAYL SRHHHSAHAI GFYVSVPKCL HWPVLAVAIL ASVVGSQAII SGTFSIINQS QSLGCFPRVK VIHTSDKMHG QIYIPEINWM 401: LMILCIAVTI GFRDVKHLGN ASGLAVMAVM LVTTCLTSLV IVLCWHKPPI LALAFLLFFG SIELLYFSAS LTKFREGAWL PILLSLIFMI IMFVWHYTTI 501: KKYEFDLQNK VSLEWLLALG PSLGISRVPG IGLVFTDLTS GIPANFSRFV TNLPAFHRVL VFVCVKSVPV PFVPPAERYL VGRVGPVDHR SYRCIVRYGY 601: RDVHQDVDSF ETELVSKLAD FIRYDWHKRT QQEDDNARSV QSNESSSESR LAVIGTVAYE IEDNLQPESV SIGFSTVESM EDVIQMAEPA PTATIRRVRF 701: AVEENSYEDE GSTSSAEADA ELRSELRDLL AAQEAGTAFI LGHSHVKAKQ GSSVMKRLAV NFGYNFLRRN CRGPDVALKV PPVSLLEVGM VYVV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)