AT2G39450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cation efflux family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a Golgi-localized manganese transporter that is involved in Mn tolerance. When expressed into yeast cells, this gene confer Mn<sup>2+</sup> and Cu<sup>2+</sup> tolerance. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MTP11; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cation efflux protein (InterPro:IPR002524); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cation efflux family protein (TAIR:AT1G79520.1); Has 5154 Blast hits to 5150 proteins in 1777 species: Archae - 162; Bacteria - 4222; Metazoa - 44; Fungi - 292; Plants - 207; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 227 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:16471744..16473735 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44633.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 394 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVEPASPDSD EGISLLEFHG NGDRSWQLNF DDFQVSPEHK EKKSPSKLHN CLGCLGPEDN VADYYQQQVE MLEGFTEMDE LAERGFVPGM SKEEQDNLAK 101: SETLAIRISN IANMLLFAAK VYASVTSGSL AIIASTLDSL LDLLSGFILW FTAFSMQTPN PYQYPIGKKR MQPLGILVFA SVMATLGLQI ILESLRTMLS 201: SHKEFNLTKE QESWVVGIML SVTLVKLLLV LYCRSFTNEI VKAYAQDHFF DVITNIIGLI AVILANYIDY WIDPVGAIIL ALYTIRTWSM TVLENVNSLV 301: GKSARPEYLQ KLTYLCWNHH KAIRHIDTVR AYTFGSHYFV EVDIVLPADM PLQVAHDIGE SLQEKLELLE EIERAFVHLD YEYTHKPEHA RSHC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)