AT2G38670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphorylethanolamine cytidylyltransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a mitochondrial ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase, involved in phosphatidylethanolamine (PE) biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phosphorylethanolamine cytidylyltransferase 1 (PECT1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Cytidyltransferase-related (InterPro:IPR004821), Cytidylyltransferase (InterPro:IPR004820); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphorylcholine cytidylyltransferase (TAIR:AT2G32260.1); Has 10984 Blast hits to 6001 proteins in 1666 species: Archae - 316; Bacteria - 5963; Metazoa - 682; Fungi - 448; Plants - 283; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 3286 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:16168979..16171680 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46980.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 421 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVWEKEKIVG SCIVGGAAFA VGASFLHLFL KGELPLGLGL GLSCPWRILR KRKPVRVYMD GCFDMMHYGH CNALRQARAL GDQLVVGVVS DEEIIANKGP 101: PVTPLHERMT MVKAVKWVDE VISDAPYAIT EDFMKKLFDE YQIDYIIHGD DPCVLPDGTD AYALAKKAGR YKQIKRTEGV SSTDIVGRML LCVRERSISD 201: THSRSSLQRQ FSHGHSSPKF EDGASSAGTR VSHFLPTSRR IVQFSNGKGP GPDARIIYID GAFDLFHAGH VEILRRAREL GDFLLVGIHN DQTVSAKRGA 301: HRPIMNLHER SLSVLACRYV DEVIIGAPWE VSRDTITTFD ISLVVHGTVA ESDDFRKEED NPYSVPISMG IFQVLDSPLD ITTSTIIRRI VANHEAYQKR 401: NAKKEASEKK YYEQKSFVSG D |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)