AT2G38490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.944 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CBL-interacting protein kinase 22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of AtCIPKs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CBL-interacting protein kinase 22 (CIPK22); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: signal transduction, protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: sperm cell, stamen; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), NAF/FISL domain (InterPro:IPR018451), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), NAF domain (InterPro:IPR004041), CBL-interacting protein kinase (InterPro:IPR020660), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: SOS3-interacting protein 4 (TAIR:AT2G30360.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:16113909..16115276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51557.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 455 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSFTIPRLFL FTLFFCSVFF VCLLMAEDSN SSESIIVNVT GDDNKSALFG KYDLGKLLGS GAFAKVYQAE DLQNGGESVA IKVVQKKRLK DGLTAHVKRE 101: ISVMRRLRHP HIVLLSEVLA TKTKIYFVME LAKGGELFSR VTSNRFTESL SRKYFRQLIS AVRYCHARGV FHRDLKPENL LLDENRDLKV SDFGLSAMKE 201: QIHPDGMLHT LCGTPAYVAP ELLLKKGYDG SKADIWSCGV VLFLLNAGYL PFRDPNIMGL YRKIHKAQYK LPDWTSSDLR KLLRRLLEPN PELRITVEEI 301: LKDPWFNHGV DPSEIIGIQA DDYDLEENGK ILNAFDLISS ASSSNLSGLF GNFVTPDHCD QFVSDESTAV IMRKVEEVAK QLNLRIAKKK ERAIKLEGPH 401: GVANVVVKVR RLTNELVMVE MKNKQRDVGL VWADALRQKL RRLINQPVYK VPDKP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)