AT2G37180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Aquaporin-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
a member of the plasma membrane intrinsic protein PIP2. functions as aquaporin and is involved in dessication. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
RESPONSIVE TO DESICCATION 28 (RD28); FUNCTIONS IN: water channel activity; INVOLVED IN: response to desiccation, response to water deprivation, transport, response to osmotic stress; LOCATED IN: plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: shoot, root, flower, cultured cell, leaf; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Major intrinsic protein, conserved site (InterPro:IPR022357), Aquaporin (InterPro:IPR012269), Major intrinsic protein (InterPro:IPR000425); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: plasma membrane intrinsic protein 2 (TAIR:AT2G37170.1); Has 10809 Blast hits to 10795 proteins in 2215 species: Archae - 81; Bacteria - 5139; Metazoa - 1474; Fungi - 455; Plants - 2518; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1140 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:15617779..15618937 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30430.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 285 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKDVEGPDG FQTRDYEDPP PTPFFDAEEL TKWSLYRAVI AEFVATLLFL YVTVLTVIGY KIQSDTKAGG VDCGGVGILG IAWAFGGMIF ILVYCTAGIS 101: GGHINPAVTF GLFLARKVSL IRAVLYMVAQ CLGAICGVGF VKAFQSSHYV NYGGGANFLA DGYNTGTGLA AEIIGTFVLV YTVFSATDPK RNARDSHVPV 201: LAPLPIGFAV FMVHLATIPI TGTGINPARS FGAAVIFNKS KPWDDHWIFW VGPFIGATIA AFYHQFVLRA SGSKSLGSFR SAANV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)