AT2G36460.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Aldolase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Aldolase superfamily protein; FUNCTIONS IN: copper ion binding; INVOLVED IN: response to cadmium ion, response to salt stress, pentose-phosphate shunt; LOCATED IN: mitochondrion, plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), Fructose-bisphosphate aldolase, class-I (InterPro:IPR000741); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Aldolase superfamily protein (TAIR:AT3G52930.1); Has 5036 Blast hits to 5030 proteins in 977 species: Archae - 0; Bacteria - 714; Metazoa - 1434; Fungi - 8; Plants - 477; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2403 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15296929..15298387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38388.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 358 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSFTSKFAD ELIANAAYIG TPGKGILAAD ESTGTIGKRL ASINVENVES NRRALRELLF TTPGALPCLS GVILFEETLY QKSSDGTPFV DMLKSAGVLP 101: GIKVDKGTVE LAGTNGETTT QGLDGLGDRC KKYYEAGARF AKWRAVLKIG VNEPSQLAIH ENAYGLARYA VICQENGLVP IVEPEILVDG SHDIQKCAAV 201: TERVLAACYK ALSDHHVLLE GTLLKPNMVT PGSESAKVAP EVIAEHTVRA LQRTVPAAVP AIVFLSGGQS EEEATRNLNA MNQLKTKKPW SLSFSFGRAL 301: QQSTLKTWGG KEENVKKAQE AFLVRCKANS EATLGAYKGD AKLGEGAAES LHVKDYKY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)