AT2G36230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Aldolase-type TIM barrel family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a BBMII isomerase involved in histidine biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ALBINO AND PALE GREEN 10 (APG10); FUNCTIONS IN: 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methylideneamino]imidazole-4-carboxamide isomerase activity; INVOLVED IN: histidine biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), Ribulose-phosphate binding barrel (InterPro:IPR011060), Histidine biosynthesis (InterPro:IPR006062), Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribotide isomerase, eukaryotic (InterPro:IPR011858); Has 5178 Blast hits to 5176 proteins in 1344 species: Archae - 226; Bacteria - 3159; Metazoa - 0; Fungi - 140; Plants - 59; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1594 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15193878..15195509 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33367.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 304 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRTLSSQLYS NGGLTWFQKK NQSSLFIKHL RVSKPSRVQL ISAVQFRPCI DIHKGKVKQI VGSTLRDLKE DGSVLVTNFE SDKSAEEYAK MYKEDGLTGG 101: HVIMLGADPL SQAAAIGALH AYPGGLQVGG GINSENCMSY IEEGASHVIV TSYVFNNGKI DLERLKDIVS IVGKQRLILD LSCRKKDGRY AIVTDRWQKF 201: SDVILDEKSL EFLGGFSDEF LVHGVDVEGK KLGIDEELVA LLGNYSPIPV TYAGGVTVMD DVERIKDAGK GRVDVTVGSA LDIFGGNLPY KDVVAWHHKQ 301: HSLH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)