AT2G35620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a plasma membrane localized leucine-rich repeat receptor kinase that is involved in cell wall elongation. Loss of function mutations of FEI1 and FEI2 exhibit defects in root and hypocotyl cell elongation. Double mutants are defective in cell wall biosynthesis and have thick hypocotyls, and short, thick roots. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
FEI 2 (FEI2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT1G31420.2); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14961187..14964640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64358.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 589 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGICLMKRCC SWFLLISFLS ALTNENEAIS PDGEALLSFR NGVLASDGVI GLWRPEDPDP CNWKGVTCDA KTKRVIALSL TYHKLRGPLP PELGKLDQLR 101: LLMLHNNALY QSIPASLGNC TALEGIYLQN NYITGTIPSE IGNLSGLKNL DLSNNNLNGA IPASLGQLKR LTKFNVSNNF LVGKIPSDGL LARLSRDSFN 201: GNRNLCGKQI DIVCNDSGNS TASGSPTGQG GNNPKRLLIS ASATVGGLLL VALMCFWGCF LYKKLGRVES KSLVIDVGGG ASIVMFHGDL PYASKDIIKK 301: LESLNEEHII GCGGFGTVYK LSMDDGNVFA LKRIVKLNEG FDRFFERELE ILGSIKHRYL VNLRGYCNSP TSKLLLYDYL PGGSLDEALH KRGEQLDWDS 401: RVNIIIGAAK GLAYLHHDCS PRIIHRDIKS SNILLDGNLE ARVSDFGLAK LLEDEESHIT TIVAGTFGYL APEYMQSGRA TEKTDVYSFG VLVLEVLSGK 501: LPTDASFIEK GFNIVGWLNF LISENRAKEI VDLSCEGVER ESLDALLSIA TKCVSSSPDE RPTMHRVVQL LESEVMTPCP SDFYDSSSD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)