AT2G35550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.987 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : basic pentacysteine 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
basic pentacysteine 7 (BPC7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GAGA binding-like (InterPro:IPR010409); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: basic pentacysteine1 (TAIR:AT2G01930.2); Has 222 Blast hits to 222 proteins in 22 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2; Fungi - 0; Plants - 220; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:14929526..14930618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29893.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 271 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLDSSFVNS SGFADFQSNN LERSNLFLYE LQREGVIFPL KLAIKMNSFP AQNLMLSATN ANKDSGLRTS NAHWLHSCIA VPKTTGIDLS QEPPAEGVMV 101: PQSHLFPPPI RDSRNDTETV KQKSVNQSPS KALKPKPQRK KRSVSNKSKK TPSIPETKRE KKNLDINIDI SSFDTSGVPP PVCSCTGVSR VCYKWGMGGW 201: QSSCCTISIS TYPLPMSTTR PGARLAGRKM SNGAYVKLLA RLADEGYDLS HPLDLKNHWA RHGTNKFVTI K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)