AT2G35370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glycine decarboxylase complex H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes glycine decarboxylase complex H protein. Involved in photorespiration. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glycine decarboxylase complex H (GDCH); FUNCTIONS IN: glycine dehydrogenase (decarboxylating) activity; INVOLVED IN: glycine decarboxylation via glycine cleavage system, photorespiration; LOCATED IN: thylakoid, mitochondrion, nucleus, chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site (InterPro:IPR003016), Single hybrid motif (InterPro:IPR011053), Glycine cleavage H-protein (InterPro:IPR002930), Glycine cleavage H-protein, subgroup (InterPro:IPR017453); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Single hybrid motif superfamily protein (TAIR:AT1G32470.1); Has 7139 Blast hits to 7139 proteins in 2207 species: Archae - 168; Bacteria - 4552; Metazoa - 189; Fungi - 126; Plants - 207; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1897 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:14891239..14892050 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17948.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 165 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALRMWASST ANALKLSSSV SKSHLSPFSF SRCFSTVLEG LKYANSHEWV KHEGSVATIG ITAHAQDHLG EVVFVELPED NTSVSKEKSF GAVESVKATS 101: EILSPISGEI IEVNKKLTES PGLINSSPYE DGWMIKVKPS SPAELESLMG PKEYTKFCEE EDAAH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)