AT2G34830.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WRKY DNA-binding protein 35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of WRKY Transcription Factor; Group II-e | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WRKY DNA-binding protein 35 (WRKY35); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding WRKY (InterPro:IPR003657), Transcription factor, WRKY group Iie (InterPro:IPR017412); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WRKY DNA-binding protein 14 (TAIR:AT1G30650.1); Has 5047 Blast hits to 3028 proteins in 237 species: Archae - 0; Bacteria - 12; Metazoa - 64; Fungi - 63; Plants - 3289; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1619 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14693839..14696378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46282.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 427 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDNFQGDLTD VVRGIGSGHV SPSPGPPEGP SPSSMSPPPT SDLHVEFPSA ATSASCLANP FGDPFVSMKD PLIHLPASYI SGAGDNKSNK SFAIFPKIFE 101: DDHIKSQCSV FPRIKISQSN NIHDASTCNS PAITVSSAAV AASPWGMINV NTTNSPRNCL LVDNNNNTSS CSQVQISSSP RNLGIKRRKS QAKKVVCIPA 201: PAAMNSRSSG EVVPSDLWAW RKYGQKPIKG SPYPRGYYRC SSSKGCSARK QVERSRTDPN MLVITYTSEH NHPWPTQRNA LAGSTRSSSS SSLNPSSKSS 301: TAAATTSPSS RVFQNNSSKD EPNNSNLPSS STHPPFDAAA IKEENVEERQ EKMEFDYNDV ENTYRPELLQ EFQHQPEDFF ADLDELEGDS LTMLLSHSSG 401: GGNMENKTTI PDVFSDFFDD DESSRSL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)