AT2G34720.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nuclear factor Y, subunit A4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nuclear factor Y, subunit A4 (NF-YA4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: CCAAT-binding transcription factor, subunit B (InterPro:IPR001289), CCAAT-binding factor, conserved site (InterPro:IPR018362); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nuclear factor Y, subunit A7 (TAIR:AT1G30500.2); Has 682 Blast hits to 682 proteins in 159 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 143; Fungi - 131; Plants - 381; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 27 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14650018..14651255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22260.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 198 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTSSVHELSD NNESHAKKER PDSQTRPQVP SGRSSESIDT NSVYSEPMAH GLYPYPDPYY RSVFAQQAYL PHPYPGVQLQ LMGMQQPGVP LQCDAVEEPV 101: FVNAKQYHGI LRRRQSRAKL EARNRAIKAK KPYMHESRHL HAIRRPRGCG GRFLNAKKEN GDHKEEEEAT SDENTSEASS SLRSEKLAMA TSGPNGRS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)