AT2G34555.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:peroxisome 0.645 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : gibberellin 2-oxidase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a gibberellin 2-oxidase that acts on C19 gibberellins to deactivate them. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
gibberellin 2-oxidase 3 (ATGA2OX3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase (InterPro:IPR005123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: gibberellin 2-oxidase (TAIR:AT1G30040.1); Has 8137 Blast hits to 8105 proteins in 983 species: Archae - 0; Bacteria - 1095; Metazoa - 80; Fungi - 810; Plants - 4851; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1301 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:+:14557102..14558682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 38218.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 7.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 335 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVIVLQPASF DSNLYVNPKC KPRPVLIPVI DLTDSDAKTQ IVKACEEFGF FKVINHGVRP DLLTQLEQEA INFFALHHSL KDKAGPPDPF GYGTKRIGPN 101: GDLGWLEYIL LNANLCLESH KTTAIFRHTP AIFREAVEEY IKEMKRMSSK FLEMVEEELK IEPKEKLSRL VKVKESDSCL RMNHYPEKEE TPVKEEIGFG 201: EHTDPQLISL LRSNDTEGLQ ICVKDGTWVD VTPDHSSFFV LVGDTLQVMT NGRFKSVKHR VVTNTKRSRI SMIYFAGPPL SEKIAPLSCL VPKQDDCLYN 301: EFTWSQYKLS AYKTKLGDYR LGLFEKRPPF SLSNV |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)